Grid Computing Internet-Based

Une lettre ouverte aux membres de D'Wild West (Une équipe Le site Combats) a été envoyé en Octobre 2000, ce qui est ci-dessous. Après sept ans de la grille UD atteint ses objectifs et reste silencieuse à partir du vendredi Avril 27, 2007.

La recherche centrée sur les protéines qui ont été été déterminées pour être une cible possible pour le traitement du cancer. Grâce à un processus appelé «criblage virtuel», un logiciel d'analyse spéciale identifié des molécules qui interagissent avec ces protéines, et déterminer lequel des candidats moléculaires eu une forte probabilité d'être développé en un médicament. Le processus est similaire à la recherche de la bonne clé pour ouvrir une serrure spéciale - en regardant des millions et des millions de clés moléculaires.

Les participants au projet ont été envoyés recherche sur le cancer d'une bibliothèque ligand sur l'Internet. Leur PC analysé les molécules en utilisant un logiciel d'accueil appelé LigandFit par Accelrys. Le logiciel LigandFit analysé les données moléculaires en utilisant un modèle tridimensionnel de tenter d'interagir avec un site protéine de liaison. Quand un ligand amarré avec succès à une protéine, l'interaction qui en résulte a été marqué et les interactions qui ont généré des scores les plus élevés ont été enregistrés et classés pour une évaluation plus poussée.

Nous avons besoin d'une meilleure réponse. Plus de cinq décennies d'efforts en recherche sur le cancer de découverte de médicaments et de développement ont abouti à plus de 40 médicaments pour le traitement des cancers. Ces médicaments anti-cancer sont de prolonger la vie de nombreuses personnes avec le cancer, mais souvent à grands frais. Les effets indésirables les plus fréquemment associés à la thérapie du cancer peut paraître souvent aussi mauvais que la maladie elle-même. Les effets secondaires peuvent être si graves qu'elles limitent les patients peuvent recevoir des doses. Et la moitié de tous les patients atteints de cancer ne répondent pas aux thérapies actuellement disponibles.

Malgré ces lacunes, ces thérapies sont encore très coûteux - une quantité considérable d'argent est dépensé sur le traitement du cancer. Le traitement des cancers représentent plus de 6% de tous les coûts de soins de santé. Le National Institutes of cancer estimation de la Santé est responsable de 37 milliards de dollars pour les coûts médicaux directs, et 11 milliards de dollars en perte de productivité due à la maladie. La découverte de nouveaux médicaments représente le meilleur espoir pour lutter contre les deux la hausse des coûts médicaux et la souffrance associée aux thérapies actuelles sur le cancer.

Il pourrait difficilement en être un combat fléau plus de valeur - le taux de mortalité élevé, la souffrance vécue par les patients, et les coûts élevés du traitement rendent la lutte contre cette maladie une priorité de recherche.

Même avec une vaste présélection, le nombre taillé en bas de molécules d'examiner pour ce projet est estimé à plus de 200 000 000 pour chaque protéine - un nombre impressionnant. L'analyse de cette quantité de quoi que ce soit nécessite une énorme quantité de puissance de calcul. Et quand les chiffres sont ce grand, même superinformatique est limité. Un super-ordinateur a une capacité de pointe. Autrement dit, si une charge de travail est de trois fois la capacité de l'ordinateur, les emplois doivent être «file d'attente" et a attaqué de façon consécutive. Un projet comme celui-ci pourrait prendre autant de temps qu'un chercheur ne serait même pas se lancer là-dessus - il ou elle ne verrait pas le résultat final dans leur vie. Cependant, avec l'informatique, répartis milliers voire des millions d'ordinateurs individuels peuvent chacun travailler sur des molécules différentes simultanément, et le temps à des résultats peut être considérablement réduite.

Diana Campbell Lettre

J'ai eu de stade IV du cancer du sein (métastases aux os) depuis septembre 2000, et a d'abord été diagnostiqué comme la phase IIIB en Janvier 1992. La dernière décennie a été un tour de montagnes russes et si vous, un membre de la famille ou un ami a un cancer, alors vous savez ce dont je parle.

J'ai commencé des recherches contre le cancer du sein de stade IV à l'été 1999, lorsque la radiographie lors d'un examen a montré un ruban suspect sur une nervure de retour. Plusieurs mois plus tard, ce ruban est une tumeur énorme, mais il avait précédemment une biopsie négative. J'ai eu un sentiment que quelque chose n'allait pas alors j'ai commencé des recherches. J'ai trouvé qu'il n'y avait pas d'informations aussi bien sur la phase IV car il y avait sur la prévention du cancer du sein et de sensibilisation ainsi que le stade précoce, le diagnostic et le traitement primaire.

J'ai donc créé ce site et le webring Survivor associé, listes de diffusion, projet de recherche et les magasins. Mon objectif était de fournir les informations ici que nous voulons tous savoir à ce stade - la plupart du temps associée à ce que nous pouvons faire pour prolonger nos vies. Je suis dans le processus de mise à jour et l'ajout, mais j'espère que ce site sera de quelque secours pour vous. S'il vous plaît joindre la grille UD trop que ce projet aidera recherche sur le cancer de vitesse et peut-être m'aider et d'autres encore très peu de temps que nous faisons face à un cancer du sein de stade IV.

Diana Campbell

Diana est décédée le 19 Février, 2003

Moins d'un mois de rejoindre l'équipe de Diana en Décembre 2000, j'ai constaté que le cancer s'était investi dans mon corps humain fragile aussi.

L'équipe initiale qui Diana formé a commencé à diminuer que le cancer a pris son péage laid. Souhaitant toujours se rappeler mon cher ami et apporter une contribution, mes ressources ont été transférées à l'AS! équipe CureNow. AS! étudie actuellement la formation d'une autre équipe avec une plus large appel au-delà de la très petite communauté des prix et sera de prendre une décision dans un avenir très proche. Je vais certainement rejoindre et une nouvelle équipe graphique avec un lien sera mis à jour dans cet espace.

Pour garder la mémoire vivante de Diana il ya maintenant différents basés sur Internet schémas de grid computing disponible, grâce au travail de pionnier de l'Université d'Oxford et de United Devices.

Le logiciel World Community Grid utilise le temps d'inactivité des ordinateurs connectés à Internet et applique cette puissance de calcul à l'avancement de l'humanité.

L'agent fonctionne comme un économiseur d'écran, en utilisant uniquement les ressources d'un ordinateur où il serait autrement être inactif et l'abandon des ressources vers les utilisateurs lorsqu'ils commencent à utiliser les ordinateurs à nouveau. L'agent peut également être exécuté comme une application, toujours en cours d'exécution dans le fond, sauf si spécifiquement désactivée / pause.

Alors que de nombreux réseaux informatiques publics tels que SETI @ home ou Folding @ home ont été consacrées à un seul projet, le World Community Grid propose plusieurs projets humanitaires dans un cadre unique. Les projets sont approuvés par un conseil consultatif, avec les membres de la plupart des grandes institutions de recherche et les universités, ainsi que l'ONU et l'OMS.

Dans la grille, les utilisateurs peuvent se joindre aux équipes qui ont été créés par des organisations, des groupes ou des individus. Les équipes permettent un sens aigu de l'identité communautaire et tente d'inspirer la compétitivité.

World Community Grid diffère également de projets de réseaux d'autres en offrant un soutien pour plus d'une infrastructure de grille. L'open source client BOINC est disponible pour Linux, Windows et Mac, le MP Grille exclusive de United Devices Inc est disponible uniquement pour Windows.

Histoire

Les États-Unis variole Devices Projet de recherche sur grille a été parrainé par IBM et d'autres participants à la recherche pour accélérer la découverte d'un remède variole. L'étude la variole utilisé la chimie computationnelle sur une grille de calcul distribué massivement pour analyser les candidats pour un traitement médical pour lutter contre le virus de la variole.

Le projet a permis aux scientifiques de dépister 35 millions de molécules médicamenteuses potentielles contre les protéines de variole plusieurs d'identifier de bons candidats pour le développement de traitements contre la variole. Dans les premières 72 heures, 100.000 résultats ont été retournés et 44 candidats pour le traitement de fortes ont été identifiés à la fin du projet.

Basé sur le succès de l'étude de la variole, IBM a annoncé le 16 Novembre 2004, la création du World Community Grid dans le but de créer un environnement technique où d'autres recherches humanitaire pourrait être traitée.

World Community Grid d'abord pris en charge uniquement sous Windows, en utilisant la technologie de grille de propriété de United Devices qui alimente grid.org projets. La forte demande pour le support de Linux a conduit à la technologie de grille open source qui alimente le BOINC SETI @ home et Climateprediction (entre autres) étant ajouté. Mac OS X est désormais incluse.

En Mars 24, 2007, le World Community Grid comptait près de 272 000 membres avec plus de 550.000 postes de travail enregistrés. Il a eu une durée totale du procédé d'exécution équivalent à environ 82000 années et environ 80 millions de résultats ont été envoyés. Les mises à jour World Community Grid ces statistiques plusieurs fois par jour, ce qui rend l'information disponible par le biais d'une page dédiée statistiques....